常用软件或软件包

Python相关

软件安装

命令行安装

python-3.8.6.win64.exe /quiet PrependPath=1 Include_test=0 CompileAll=1

Linux中使用pip3，windows中使用pip

pip3 install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple --user scipy
pip install -U -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple jupyter pygame biopython

换源相关脚本：

# ustc较快
http://biopy.vip/data/app/switch_apt_source.sh
http://biopy.vip/data/app/switch_conda_source.sh
http://biopy.vip/data/app/switch_pip_source.sh

WSL相关

重启WSL：开启管理员power shell，然后运行 Get-Service LxssManager | Restart-Service
wsl.exe --list online 列出可用的 Linux 发行版
wsl.exe --install distribution <Distribution Name> 安装特定的发行版
wsl.exe --list verbose 列出已安装的 Linux 发行版
wsl.exe --set-default-version <Version> 设置默认 WSL 版本
wsl.exe --status 检查 WSL 状态
wsl.exe --update 更新 WSL

Docker相关

# 添加docker源
add-apt-repository "deb [arch=amd64] https://download.docker.com/linux/ubuntu $(lsb_release -cs) stable"
# 安装docker
apt install docker-ce docker-ce-cli containerd.io
# 查看docker状态
systemctl status docker
# 将用户加入docker组
usermod -aG docker test # 之后重新登录
# 重新登录之后运行groups命令，看看docker在不在里面，不在的话运行下面的命令会报错
# 用户使用docker
docker pull trinityrnaseq/trinityrnaseq

pip换源：win+r，cmd回车

mkdir %appdata%\pip
echo [global] > %appdata%\pip\pip.ini
echo index-url=https://pypi.doubanio.com/simple/ >> %appdata%\pip\pip.ini
echo [install] >> %appdata%\pip\pip.ini
echo trusted-host=pypi.doubanio.com >> %appdata%\pip\pip.ini